陆军军官学校校长，就任当天，他在全校师生面前立誓：
“我此次奉命来掌管本校，一定要使本校成为最完整之军校，使在学诸君为最优秀之军官。将来治军，能训练出最精锐良好之军队。我必当献身于这一任务，实践斯言！万一不效，当自戕以谢天下！”
上任后，他确实在军纪、教学、校务、校风等方面准备进行大刀阔斧的改革。
然后到了六月中旬一个清晨，蒋百里用集合号召集全校师生，站在尚武堂的石阶上，神色凝重地对他们说：
“我曾经教训过你们，我要你们做的事，你们必须办到，你们要我做的事，我同样也要办到。你们办不到，我要责罚你们，我办不到，我要责罚我自己。现在你们一切都还好，没有对不起我的事，我自己不能尽责任，是我对不起你们！”
说完就拔枪对准自己心脏，幸亏旁边护卫手快，让子弹偏了几寸，没有射中心脏，只是擦着一点肺，从两肋间穿出。
事情发生得突然，袁世凯忙派曹汝霖安排他到了日本公使馆就医。